本重点实验室只招收学术型研究生。本单位已建成了一套完整的“硕士-博士-博士后”高层次、多学科交叉的人才培养体系，现有博士学位点5个，其中包括光学国家重点学科，生物物理学、生物医学光子学、声学、分析化学；硕士学位点6个，其中包括光学、光学工程、生物物理学、声学、生物医学光子学、分析化学；博士后流动站2个，其中包括物理学、生物学（生物光子学方面）。
2023年全日制硕士招生专业计划表
| 序号 | 单位代码 | 单位名称 | 专业类别 | 专业代码 | 专业名称 |
| 1 | 020 | 生物光子学研究院 | 学术型 | 070200 | 物理学 |
| 2 | 020 | 生物光子学研究院 | 学术型 | 070302 | 分析化学 |
| 3 | 020 | 生物光子学研究院 | 学术型 | 071011 | 生物物理学 |
| 4 | 020 | 生物光子学研究院 | 学术型 | 100704 | 药物分析 |
| 5 | 020 | 生物光子学研究院 | 学术型 | 080300 | 光学工程 |
| 6 | 020 | 生物光子学研究院 | 专业学位 | 085406 | 控制工程 |
| 7 | 020 | 生物光子学研究院 | 专业学位 | 085407 | 仪器仪表工程 |
| 8 | 020 | 生物光子学研究院 | 专业学位 | 085408 | 光电信息工程 |
| 9 | 020 | 生物光子学研究院 | 专业学位 | 085409 | 生物医学工程 |